Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933436I01RikQ9D3T1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms