Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms