Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd2Q9D1L0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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