Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf146Q9CZW6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms