Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc77Q9CZH8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc77Q9CZH8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc77Q9CZH8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc77Q9CZH8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc77Q9CZH8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms