Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thumpd2Q9CZB3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms