Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nde1Q9CZA6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms