Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl35Q9CZ49 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl35Q9CZ49 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms