Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssu72Q9CY97 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms