Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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