Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CWU4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms