Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx2Q9CWK8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms