Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms