Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nicn1Q9CQM0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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