Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudt21Q9CQF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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