Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4921530L21RikQ9CQ47 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms