Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim8Q99PJ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms