Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcgf6Q99NA9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcgf6Q99NA9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms