Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf17Q99MV7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms