Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd1Q99MV1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms