Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp16Q99LG0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp16Q99LG0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms