Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q99KU6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q99KU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q99KU6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms