Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms