Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Clint1Q99KN9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clint1Q99KN9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clint1Q99KN9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Clint1Q99KN9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clint1Q99KN9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clint1Q99KN9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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