Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab28Q99KL7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms