Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms