Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctu1Q99J10 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ctu1Q99J10 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctu1Q99J10 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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