Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc8b1Q925Q3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc8b1Q925Q3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms