Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn16Q925N4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms