Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms