Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms