Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clip1Q922J3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clip1Q922J3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms