Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Odf3Q920N1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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