Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms