Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Basp1Q91XV3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Basp1Q91XV3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms