Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vps11Q91W86 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vps11Q91W86 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vps11Q91W86 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vps11Q91W86 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vps11Q91W86 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps11Q91W86 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps11Q91W86 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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