Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usb1Q91W78 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms