Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klc3Q91W40 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klc3Q91W40 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms