Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp3Q91W36 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp3Q91W36 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms