Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd3Q91W18 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms