Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc71Q8VEG0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc71Q8VEG0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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