Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VDP2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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