Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ttc8Q8VD72 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ttc8Q8VD72 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ttc8Q8VD72 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ttc8Q8VD72 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc8Q8VD72 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms