Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpap2Q8VC34 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpap2Q8VC34 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpap2Q8VC34 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpap2Q8VC34 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms