Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms