Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolbQ8K409 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolbQ8K409 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolbQ8K409 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolbQ8K409 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolbQ8K409 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PolbQ8K409 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PolbQ8K409 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms