Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms