Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c1Q8K284 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms