Protein–RNA interactions for Protein: Q8K025

Frat2, GSK-3-binding protein FRAT2, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat2Q8K025 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frat2Q8K025 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frat2Q8K025 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms