Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh2d5Q8JZW5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh2d5Q8JZW5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms